Så hittade svenska forskare 300 nya proteiner

Cellcykeln, alltså den process där celler delar sig, är viktig för alla levande organismer (se ruta). Det väckte därför uppmärksamhet när Emma Lundberg, professor i cellbiologisk proteomik vid Kungliga Tekniska Högskolan, KTH, i Stockholm, och hennes medarbetare i slutet av februari kunde presentera sina nya resultat.

– Cellcykeln är extremt välstuderad, eftersom det är en helt fundamental process, men ofta har forskare koncentrerat sig på att kartlägga vilka gener som är aktiva i olika stadier av cellcykeln. Vårt fokus är i stället att kartlägga proteiner, och då vi studerade celler i olika stadier av celldelning hittade vi 300 tidigare okända cellcykel-proteiner, säger Emma Lundberg.

Kartlägger mänskliga proteiner

I sin forskning arbetar hon med att kartlägga proteiner för projektet Human Protein Atlas, en databas som är tillgänglig för forskare inom både akademin och företag. Som ett led i detta arbete kunde bland annat hennes grupp år 2017 i tidskriften Science presentera en milstolpe – en översikt över var olika proteiner finns, exempelvis om de förekommer i cellkärnan eller i organeller som i mitokondrier. I studien studerade de cellerna med hjälp av en teknik kallad immuno-fluorecensmikroskopi. 

– När vi studerade cellerna såg vi att identiska celler ibland verkade ha helt olika proteinprofiler. Den ena kunde ha låga halter av ett protein som cellen bredvid hade massor av. Vår teori var att det kunde ha med olika stadier i cellcykeln att göra och vi ”flaggade” de celler där vi såg fenomenet, säger hon.

När de sedan systematiskt studerade de flaggade cellerna, och cell för cell noggrant analyserade vilka proteiner varje cell innehöll, visade sig teorin stämma.

– Det är ett häftigt resultat! De nya proteiner som vi har hittat styrs till stor del inte på gennivå, utan i stället regleras de förmodligen direkt på proteinnivå. Exempelvis av att de stabiliseras eller bryts ner i någon fas av celldelningen, säger Emma Lundberg.

Kan bidra till ny kunskap vid cancer

Hon hoppas att den nya kunskapen ska kunna utgöra en värdefull resurs, inte minst för forskare som arbetar med olika slags cancer.

– Det finns i dag proteiner som man vet är aktiva i celldelningen och som går att använda som markörer för att kunna bedöma hur aggressiv en tumör är. Nu när det finns en större samling cellcykel-proteiner att titta på, kanske det går att hitta nya sådana markörer, säger hon.

Emma Lundberg är noga med att betona att de nya resultaten som publiceras i tidskriften Nature har sin grund i ett intensivt lagarbete.

– Vi har slitit med detta i fyra år! Mina medarbetare Anthony Cesnik och Diana Mahdessian är båda försteförfattare, så de är de egentliga stjärnorna bakom denna studie, säger hon.